使用DNAMAN怎么对比核酸序列-DNAMAN使用教程

互联网 2020-10-20 09:19:15

  很多朋友表示不太清楚怎么使用DNAMAN对比核酸序列?下面小编就将和大家一起分享关于使用DNAMAN对比核酸序列的方法,有需要的朋友可以来看看哦,希望可以帮助到各位朋友。

  方法1:

  1.在电脑上打开DNAMAN软件,打开File-New,将序列粘贴到弹出的窗口中,点击File-save,保存到指定的文件夹。

如何用DNAMAN 对比核酸序列
如何用DNAMAN 对比核酸序列
如何用DNAMAN 对比核酸序列

  方法2:

  1.将所需比对的序列保存好以后,选中Sequence—Aligment—Multiple aligment sequence进行多序列比较。

如何用DNAMAN 对比核酸序列

  2.在弹出的窗口Sequence&Files中加载序列,File、Fold、channel、Database分别表示从文件、文件夹、channel和数据库中获取序列。勾选窗口中的“DNA”,点击“下一步”。

如何用DNAMAN 对比核酸序列

  3.在弹出的窗口Method中,“optimalaligment”最佳比对方式中有四个高大上的选项:Full Alignment(完全比对)、 Prosile Aligment(轮廓比对)、 New Swquence on Profile (轮廓上的新序列)、Fast Alignment(快速比对),本文选择了Fast Alignment,并且勾选了Try both strands(尝试使用双链)。其他项目不需修改,默认就OK,点击“下一步”。

如何用DNAMAN 对比核酸序列

  4.“Duang”,结果就出来啦!点击“Option”可以选择要显示的内容。

如何用DNAMAN 对比核酸序列

  方法3:

  1.保存:点击File-output-Graphic(EMF)File,该序列比对的结果窗口可以图片格式保存。

如何用DNAMAN 对比核酸序列

  2.做进化树分析,并保存,就完成了。

如何用DNAMAN 对比核酸序列

  以上就是小编分享的使用DNAMAN对比核酸序列的方法,还不太清楚的朋友可以来学习一下哦。

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